全雷竞技官网app组de novo雷竞技竞猜

产品介绍常见问题经典案例结果展示


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雷竞技官网app组雷竞技竞猜开启物种真正探索之路

雷竞技官网app组从头雷竞技竞猜(De novo sequencing)
在不依赖参考雷竞技官网app组的情况下对某物种进行雷竞技官网app组雷竞技竞猜及拼接组装,
从而绘制该物种的全雷竞技官网app组序列图谱。雷竞技官网app组雷竞技竞猜不仅可以获得该物种的全雷竞技官网app组序列图谱,
同时也为后续物种起源进化及特定环境适应性的研究奠定了基础。
根据雷竞技官网app组的复杂程度,雷竞技官网app组可分为简单雷竞技官网app组和复杂雷竞技官网app组。

简单雷竞技官网app组
复杂雷竞技官网app组
重复序列比例
<50%
>50%
杂合率
<0.5%
>0.5%

科学方案设计

从材料选取,建库雷竞技竞猜,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

纯三代

基于顶尖组装水平,简单或复杂雷竞技官网app组高质量组装

简单雷竞技官网app组De novo 雷竞技竞猜
复杂雷竞技官网app组De novo 雷竞技竞猜

样本要求

DNA总量>10 ug
送样指南链接>>

文库类型

PacBio:10~40 Kb大片段文库、60~70 Kb大片段文库;
Nanopore: Ligation 1D文库

雷竞技竞猜策略与深度

三代(80×)+10×
Genomics/BioNano/Hi-C

三代(100×)+10×
Genomics/BioNano/Hi-C

承诺指标

Contig N50≥2 Mb,
Scaffold N50≥5 Mb

Contig N50≥20 Kb,
Scaffold N50≥1 Mb

10X Genomics De novo

基于顶尖组装水平,简单雷竞技官网app组高质量组装

样本要求

DNA总量>2.5 ug

文库类型

10× Genomics文库

雷竞技竞猜策略与深度

雷竞技官网app组<1.2 Gb, 120 Gb;雷竞技官网app组≥1.2 Gb,100×

承诺指标

Contig N50≥30Kb,Scaffold N50≥1Mb

超长文库 De novo

基于顶尖组装水平,组装超完美雷竞技官网app组组

样本要求

DNA总量>10 ug

雷竞技竞猜策略

30× Ultra-long reads 文库 + 50~100× ONT 普通文库 + 100× BioNano
DLS + 100× Hi-C + 100× Illumina

信息分析

雷竞技官网app组序列是研究物种分子生物学的基础,通过全雷竞技官网app组De novo雷竞技竞猜,
可得到物种全雷竞技官网app组序列图谱,通过比较雷竞技官网app组学分析可对物种进行基
因家族分析,系统进化分析,正选择分析和共线性分析。

De novo 雷竞技竞猜
分析内容
组装
组装策略
组装结果评估
注释
重复序列注释
雷竞技官网app结构注释
雷竞技官网app功能注释
非编码RNA注释
生物学分析
比较雷竞技官网app组学分析
雷竞技官网app家族分析
系统进化分析
正选择分析
共线性分析
个性化分析
针对物种自身特点
制定分析方案
有参考雷竞技官网app组De novo 雷竞技竞猜
特有雷竞技官网app检测
变异检测

因为专业,所以卓著。

采用Falcon、Canu、wtdbg2 等雷竞技官网app组组装软件及 Racon、Quiver 、Pilon 等纠错软件,从纯三代、10X Genomics到结合新技术混合拼接,
针对不同的雷竞技官网app组特征,采取不同的策略,致力于得到最优的组装结果。
因为专注,所以专业,诺禾致源始终引领着雷竞技官网app组学的发展。

悦读高质量雷竞技竞猜数据,尽享HPC澎湃动力

雷竞技官网app组De novo 雷竞技竞猜采用先进的Illumina雷竞技竞猜平台,快速、高效地读取高质量的雷竞技竞猜数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的雷竞技竞猜数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节,助力科学研究。

诺禾致源的雷竞技官网app组合作项目遍布全球各地,引领雷竞技官网app组研究潮流。
截止2019年7月,发表高水平雷竞技官网app组文章34篇(IF>10)。研究涉及鸟类、
哺乳动物、水产生物、珍稀动物、昆虫、栽培作物、水果植物、药用植物、藻类、林木类、灌木类等诸多物种。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。